دوره 5، شماره 4 - ( زمستان 1397 )
جلد 5 شماره 4 صفحات 506-495 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Khorasani M, Shahbazi S, Mahdian R. Bioinformatics Study of the miR-200 Family and the Target Genes in Prostate Cancer. jhbmi 2019; 5 (4) :495-506
URL: http://jhbmi.ir/article-1-313-fa.html
URL: http://jhbmi.ir/article-1-313-fa.html
خراسانی مریم، شهبازی شیرین، مهدیان رضا. مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-200 و ژن‌های هدف آن در سرطان پروستات. مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1397; 5 (4) :495-506
دکترای بیوتکنولوژی پزشکی، دانشیار گروه پزشکی مولکولی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
چکیده: (5601 مشاهده)
مقدمه: با توجه به محدودیت‌های تست تشخیصی رایج سرطان پروستات، معرفی بیومارکرهای با ویژگی بالاتر جهت تشخیص دقیق‌تر و به‌هنگام سرطان پروستات مورد توجه می‌باشد. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی خانواده miR-200 (miR-200a, miR-200b, miR-200c, miR-141, miR-429) و پیشبینی هدف‌های ژنی این خانواده، جهت بررسی بیشتر تحت عنوان بیوماکر تشخیصی بود.
روش: این تحقیق از نوع تئوری و بر پایه بررسی بیوانفورماتیکی میکرو RNA بود که به منظور جستجوی ژن‌های هدف خانواده miR-200 در مسیرهای سیگنالینگ شناخته شده در پاتوژنز سرطان پروستات از پایگاه DIANA TOLLS-mirPath v.3 استفاده شد. سپس به تأیید ژن‌های معرفی شده توسط ابزارهای پیشگویی کننده آنلاین مانند MiRWalk, Targetscan, RNAhybrid, پرداخته شد. در انتها نقش عملکردی ژن‌های هدف معرفی شده توسط پایگاه بیوانفورماتیک DAIVID بررسی شد.
نتایج: با توجه به نتایج حاصل از این بررسی ژن E2F3 هدف مشترک تمام اعضای خانواده miR-200 است، BCL2 به عنوان هدف مشترک miR-200b/c/429 و CCNE2 به عنوان هدف مشترک miR-200a/141 بودند. همچنین miR-200c با هدف قرار دادن CDKN1B و miR-429 با هدف قرار دادن KRAS می‌تواننند در ایجاد سرطان پروستات مداخله کنند.
نتیجه‌گیری: نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که اعضای خانواده miR-200 با هدف قرار دادن ژن‌های دخیل در پروسه‌های بیولوژیکی مهم و مسیرهای مولکولی دخیل در پاتوژنز سرطان پروستات احتمالاً می‌توانند تحت عنوان بیومارکر تشخیصی در مطالعات آتی مورد بررسی بیشتر قرار بگیرند.
روش: این تحقیق از نوع تئوری و بر پایه بررسی بیوانفورماتیکی میکرو RNA بود که به منظور جستجوی ژن‌های هدف خانواده miR-200 در مسیرهای سیگنالینگ شناخته شده در پاتوژنز سرطان پروستات از پایگاه DIANA TOLLS-mirPath v.3 استفاده شد. سپس به تأیید ژن‌های معرفی شده توسط ابزارهای پیشگویی کننده آنلاین مانند MiRWalk, Targetscan, RNAhybrid, پرداخته شد. در انتها نقش عملکردی ژن‌های هدف معرفی شده توسط پایگاه بیوانفورماتیک DAIVID بررسی شد.
نتایج: با توجه به نتایج حاصل از این بررسی ژن E2F3 هدف مشترک تمام اعضای خانواده miR-200 است، BCL2 به عنوان هدف مشترک miR-200b/c/429 و CCNE2 به عنوان هدف مشترک miR-200a/141 بودند. همچنین miR-200c با هدف قرار دادن CDKN1B و miR-429 با هدف قرار دادن KRAS می‌تواننند در ایجاد سرطان پروستات مداخله کنند.
نتیجه‌گیری: نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که اعضای خانواده miR-200 با هدف قرار دادن ژن‌های دخیل در پروسه‌های بیولوژیکی مهم و مسیرهای مولکولی دخیل در پاتوژنز سرطان پروستات احتمالاً می‌توانند تحت عنوان بیومارکر تشخیصی در مطالعات آتی مورد بررسی بیشتر قرار بگیرند.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
