[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 3، شماره 2 - ( تابستان 1395 ) ::
جلد 3 شماره 2 صفحات 118-131 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی و مقایسه روند تکاملی زیر واحد TERT تلومراز از گیاهان تا مهره داران با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی و محاسباتی
مانوی نعیمی، آپتین راهنورد
دکتری علوم گیاهان داروئی، استادیار و عضو هیئت علمی گروه مهندسی محیط زیست، دانشکده علوم زیستی، منابع طبیعی و گیاهان دارویی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن، تنکابن، ایران.
چکیده:   (1418 مشاهده)

مقدمه: تلومر پایانه فیزیکی کروموزوم های خطی می باشد که از یک توالی غیر کد کننده تشکیل یافته و در حفاظت انتهای کروموزوم ها نقش دارد. بنابراین سیر تکاملی تلومراز ، آنزیم سازنده تلومر، و ساختار آن در گونه های مختلف جای بحث دارد. هدف در این تحقیق جمع آوری توالی های خانواده ژنی تلومراز و مقایسه آنها جهت یافتن موتیف های حفاظت شده و بررسی قرابت TERT سایر گونه ها با انسان می باشد که با استفاده از ابزارهای بیو انفورماتیکی انجام می شود. مطالعات قبلی آنالیزهای فیلوژنی تلومراز، محدود به یک سطح پروتئین یا mRNA بوده است اما در این کار مطالعات بر روی 3 سطح پروتئین، mRNA وDNA انجام می شود.  با توجه به اینکه توالی های ترتیب گذاری شده موجودات افزایش یافته است، ترکیب اطلاعات گیاهان و جانوران یک چالش مورد توجه می باشد. همچنین کسب اطلاعات بیشتر در مورد ساختار بخش آنزیمی تلومراز، راه های نوینی برای سرکوب این آنزیم در سرطان ها باز می کند.

روش: گونه ها با حداقل 35% شباهت تکاملی در طیف گیاه تا مهره دار انتخاب شدند. توالی ها با  برنامه ClastalW همتراز سازی شدند. درخت تکاملی ارگانیسم ها با برنامه Mega5، رسم شد. و از برنامه Scanprosite  برای جستجوی موتیف پروتئینی استفاده شد.

نتایج: قرابت TERT انسانی با سایر گونه ها در بخش C-ترمینال عنوان شد. بخش های حفظ شده آمینواسیدی مشخص و دومین ترانسکریپتاز معکوس به عنوان موتیف حفاظت شده ی عملکردی تمام گونه ها در سطح پروتئین معرفی شد.

نتیجه گیری: حذف یا اختلال در دومین RT-POL ناکارآمدی آنزیم را در تمامی گونه ها در پی خواهد داشت. همچنین بخش N-ترمینال TERT هدف مناسبی برای مهار تلومراز در سرطان پستان، به دلیل حفظ شدگی بالا در پستانداران، عنوان شد.

واژه‌های کلیدی: بیوانفورماتیک، فیلوژنتیک، تلومراز، سرطان
متن کامل [PDF 1082 kb]   (748 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: ۱۳۹۵/۵/۲۵ | پذیرش: ۱۳۹۵/۶/۱۸
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Naeimi M, Rahnavard A. Comparison of the Evolutionary Process of the TERT Subunits of Telomerase Between Plants and Vertebrates Using Bioinformatics and Computational Methods. Journal of Health and Biomedical Informatics. 2016; 3 (2) :118-131
URL: http://jhbmi.ir/article-1-154-fa.html

نعیمی مانوی، راهنورد آپتین. بررسی و مقایسه روند تکاملی زیر واحد TERT تلومراز از گیاهان تا مهره داران با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی و محاسباتی. مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1395; 3 (2) :118-131

URL: http://jhbmi.ir/article-1-154-fa.html



دوره 3، شماره 2 - ( تابستان 1395 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی Journal of Health and Biomedical Informatics
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3705