@ARTICLE{Zarrabi, author = {Ebrahimi Tarki, Fatemeh and Bourbour, Mahsa and Zarrabi, Mahboobe and }, title = {Design, Modeling and Computational Analysis of crRNA to Regulate MetastamiR-10b and MetastamiR-126 in Post-transcriptional Level by CRISPR-C2c2 (Cas13a) Technique}, volume = {6}, number = {4}, abstract ={مقدمه: یکی از مهم‌ترین دلایل مرگ‌و‌میر در بین بیماران سرطانی متاستاز است. اخیراً نشان داده شده است که گروه خاصی از miRNA‌ها(microRNA) که metastamir نامیده می‌شوند دارای اثر متاستاتیکی هستند. miR-126 ارتباط مشخصی با متاستاز سرطان روده به کبد دارد. همچنین در متاستاز سرطان سینه miR-10b بیان بیش از حد پیدا می‌کند؛ بنابراین کاهش سطح بیان این miRNA‌ها می‌تواند نقش مهمی در کاهش احتمال متاستاز داشته باشد. در این تحقیق تکنیک CRISPR-C2c2(Cas13a) به منظور هدف‌گیری پیش‌سازهای miRNA جهت کاهش اثر متاستاتیکی آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. روش: پژوهش با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک و بیوانفورماتیک ساختاری انجام شد. ساختار آنزیم C2c2 از پایگاه داده RCSB و توالی‌های miRNA و پیش‌سازهای آن‌ها از پایگاه‌های داده MirBase و Mirnamap تهیه شدند. با استفاده از سیستم برخط CRISPR-RT، crRNA‌های هدف گیرنده توالی مورد نظر طراحی و از نظر اختصاصیت مورد بررسی و ارزیابی قرار گرفتند. ساختار سه بعدی crRNA‌های طراحی شده با استفاده از نرم‌افزار RNAbuider2.8.2 شبیه‌سازی و به منظور بررسی نحوه اتصال و سطح انرژی اتصالی crRNA با آنزیم C2c2(Cas13a) از سرور Hdock استفاده شد. نتایج:crRNA طراحی شده با هدف mir-126 مشابهت ساختاری بالا با وضعیت مشاهده شده در طبیعت نشان داده و جهت­گیری مناسب حاصل شد. در مورد crRNA طراحی شده به منظور هدف­گیری mir-10b با وجود اختصاصیت بالا جهت­گیری درستی ایجاد نشد. نتیجه­گیری: بررسی توالی محور crRNA‌های طراحی شده برای ویرایش در سطح RNA کافی نیست و توصیه می­شود در کنار بررسی­های برپایه اختصاصیت، شبیه­سازی و داکینگ مولکولی به منظور دقت هر چه بیشتر انجام شود. }, URL = {http://jhbmi.ir/article-1-390-fa.html}, eprint = {http://jhbmi.ir/article-1-390-fa.pdf}, journal = {Journal of Health and Biomedical Informatics}, doi = {}, year = {2020} }