fa بررسی و مقایسه روند تکاملی زیر واحد TERT تلومراز از گیاهان تا مهره داران با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی و محاسباتی تخصصي Special پژوهشي اصیل Original Article <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>مقدمه:</strong> تلومر پایانه فیزیکی کروموزوم های خطی می باشد که از یک توالی غیر کد کننده تشکیل یافته و در حفاظت انتهای کروموزوم ها نقش دارد. بنابراین سیر تکاملی تلومراز ، آنزیم سازنده تلومر، و ساختار آن در گونه های مختلف جای بحث دارد. هدف در این تحقیق جمع آوری توالی های خانواده ژنی تلومراز و مقایسه آنها جهت یافتن موتیف های حفاظت شده و بررسی قرابت <span dir="LTR">TERT</span> سایر گونه ها با انسان می باشد که با استفاده از ابزارهای بیو انفورماتیکی انجام می شود. مطالعات قبلی آنالیزهای فیلوژنی تلومراز، محدود به یک سطح پروتئین یا <span dir="LTR">mRNA</span> بوده است اما در این کار مطالعات بر روی 3 سطح پروتئین، <span dir="LTR">mRNA</span> و<span dir="LTR">DNA</span> انجام می شود.&nbsp; با توجه به اینکه توالی های ترتیب گذاری شده موجودات افزایش یافته است، ترکیب اطلاعات گیاهان و جانوران یک چالش مورد توجه می باشد. همچنین کسب اطلاعات بیشتر در مورد ساختار بخش آنزیمی تلومراز، راه های نوینی برای سرکوب این آنزیم در سرطان ها باز می کند.</p> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>روش: </strong>گونه ها با حداقل 35% شباهت تکاملی در طیف گیاه تا مهره دار انتخاب شدند. توالی ها با&nbsp; برنامه <span dir="LTR">ClastalW</span> همتراز سازی شدند. درخت تکاملی ارگانیسم ها با برنامه <span dir="LTR">Mega5</span>، رسم شد. و از برنامه <span dir="LTR">Scanprosite</span>&nbsp; برای جستجوی موتیف پروتئینی استفاده شد.</p> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>نتایج: </strong>قرابت <span dir="LTR">TERT</span> انسانی با سایر گونه ها در بخش <span dir="LTR">C</span>-ترمینال عنوان شد. بخش های حفظ شده آمینواسیدی مشخص و دومین ترانسکریپتاز معکوس به عنوان موتیف حفاظت شده ی عملکردی تمام گونه ها در سطح پروتئین معرفی شد.</p> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>نتیجه گیری</strong>: حذف یا اختلال در دومین <span dir="LTR">RT-POL</span> ناکارآمدی آنزیم را در تمامی گونه ها در پی خواهد داشت. همچنین بخش <span dir="LTR">N</span>-ترمینال <span dir="LTR">TERT</span> هدف مناسبی برای مهار تلومراز در سرطان پستان، به دلیل حفظ شدگی بالا در پستانداران، عنوان شد.</p> <p style="text-align: justify;"></p> <p style="text-align: justify;"><strong>Introduction:</strong> Telomere is the physical terminal of linear chromosomes composed of a non-coding sequence that protects the ends of chromosomes. Therefore, evolutionary process of telomerase, as the synthase enzyme of telomere, and its structure in various species should be discussed. The aim of this study was to collect the sequences of telomerase gene family and compare them in order to find motifs protected by this gene family and investigate the proximity of human TERT with other species using bioinformatics and computational methods. This study was performed on the 3 levels of protein, mRNA, and DNA. As the sequences of organisms have been increased, combining plants&rsquo; and animals&rsquo; data is a challenge. Also, more information about the structure of telomerase can help to find new ways to inhibit this enzyme in cancer.</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Method:</strong> In this in silico study, species had at least 35% evolution similarity were selected from plants and vertebrates. Sequences were aligned using ClastalW program. Organisms&rsquo; evolutionary tree was drawn using MEGA5 software and protein motifs were detected using ScanProsite software.</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Results:</strong> Proximity of human TERT with other spices was observed in C-terminal region. Amino acid parts preserved were detected and the reverse transcriptase domain was introduced as conserved functional motifs of all species at protein level.</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Conclusion</strong>: Any removal or disturbance in RT-POL domain lead to enzyme deficiencies in all species. Also, the N-terminal region of TERT because of its high preservation in mammals, was introduced as an attractive target for inhibition of telomerase in breast cancer.</p> بیوانفورماتیک, فیلوژنتیک, تلومراز, سرطان Bioinformatics, Phylogenetics, Telomerase, Cancer 118 131 http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-210-1&slc_lang=fa&sid=1 Manevey Naeimi مانوی نعیمی maneveynaeimi@gmail.com 10031947532846002629 10031947532846002629 No دانشجوی کارشناسی ارشد زیست‌شناسی سلولی و مولکولی گرایش سلولی و مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن، تنکابن، ایران Aptin Rahnavard آپتین راهنورد rahnavard_aptin@yahoo.com 10031947532846002630 10031947532846002630 Yes Ph.D in Pharmaceutic Plants, Assistance Professor Environment Engineering Dept., Pharmaceutic Plants & Environment Source, Islamic Azad University, Tonekabon Branch, Tonekabon, Iran دکتری علوم گیاهان داروئی، استادیار و عضو هیئت علمی گروه مهندسی محیط زیست، دانشکده علوم زیستی، منابع طبیعی و گیاهان دارویی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن، تنکابن، ایران.