fa بررسی بیوانفورماتیکی برهمکنش آندروژن رسپتور با داروی بیکالوتامید تخصصي Special پژوهشي اصیل Original Article <p dir="RTL"><strong>زمینه و هدف:</strong> اکثر قریب به اتفاق داروها با اتصال به پروتئین هدف خود عمل می&rlm;کنند. پیش&shy; بینی برهمکنش&shy; بین مولکول&rlm;های کوچک و پروتئین&shy;ها، یک عنصر کلیدی در فرایند کشف دارو محسوب می&rlm;شود. پیشرفت در ژنتیک ساختاری، دسترسی به ساختارهای سه بعدی پروتئین&rlm;هایی که مورد هدف دارو قرار می&rlm;گیرند را برای ما امکان&rlm;پذیر کرده است. با توجه به اینکه پروسه<span dir="LTR">&lrm;</span>های آزمایشگاهی در ارتباط با بررسی برهمکنش&rlm;های بین دارو و پروتئین هدف آن با صرف هزینه<span dir="LTR">&lrm;</span> و انرژی بالا صورت می&rlm;گیرد، بهره&rlm;گیری از &nbsp;روش&shy;های<em><span dir="LTR">in silico</span></em> می&rlm;تواند راهکار مؤثری برای ارائه&rlm;ی اطلاعات مفید در حمایت از روش&rlm;های تجربی باشد.</p> <p dir="RTL"><strong>روش بررسی:</strong> در این پژوهش نحوه&shy;ی برهمکنش آندروژن رسپتور با داروی بیکالوتامید، به عنوان یک داروی پرکاربرد در درمان سرطان پروستات، با استفاده از آنالیزهای محاسباتی مورد بررسی قرار گرفته است.</p> <p dir="RTL"><strong>یافته&shy; ها:</strong> اطلاعات حاصل از این پژوهش نشان داد، اسیدهای آمینه&shy;ی <span dir="LTR">Met-895</span>، <span dir="LTR">Trp-741</span>، <span dir="LTR">Arg-752</span>،<br> <span dir="LTR">Ile-899 </span>، <span dir="LTR">Leu-707</span>،<span dir="LTR">Gly-708</span> ،<span dir="LTR">Gln-711 </span>،<span dir="LTR">Met-745</span> ، <span dir="LTR">Met-749</span>، <span dir="LTR">Thr-877</span>، <span dir="LTR">Phe-764</span> و &nbsp;<span dir="LTR">Met-742</span>که در پیوند هیدروفوب و اسیدهای آمینه&shy;ی <span dir="LTR">Asn-705</span> و <span dir="LTR">Leu-704</span> که در پیوند هیدروژنی با دارو&nbsp; قرار دارند، نقش بسزایی در برهمکنش میان این پروتئین و دارو ایفا می&shy;نمایند.</p> <p dir="RTL"><strong>نتیجه&shy; گیری:</strong> نتایج حاصل را می&shy;توان در مراحل بعد، جهت بررسی مقاومت&shy;های دارویی به بیکالوتامید و نیز جهت طراحی داروهایی کارآمدتر مورد استفاده قرار داد.</p> <div style="text-align: justify;"><strong>Introduction:</strong> The majority of drugs act through binding with target proteins. Prediction of the interaction between small molecules and proteins is a key element in the process of drug discovery. Advances in Structural Genomics have provided this possibility to access three-dimensional structures of the proteins which are targeted by drugs. Since laboratory processes through which drug-target protein interactions are investigated require high cost and energy, in silico methods can be used as effective strategies for providing useful information in support of experimental methods.<br> <strong>Methods:</strong> In this study, the interaction between androgen receptor and Bicalutamide, a widely used drug in the treatment of prostate cancer, was investigated via computational analyses. The docking analysis of this receptor with Bicalutamide was done using Autodock4.2.6 and analysis of complexes was done through LigPlot4.5.3 and Chimera1.5.3.<br> <strong>Results:</strong> The obtained results showed that amino acid residues Met-895, Trp-741, Arg-752, Ile-899, Leu-707, Gly-708, Gln-711, Met-745, Met-749, Thr-87, Phe-764, and Met-749 (through forming hydrophobic bonds with the drug) and amino acid residues Asn-705 and Leu-704 (through forming hydrogen bonds with the drug) play a significant role in the protein-drug interaction and cause proper positioning of the drug in protein and consequently its efficacy.<br> <strong>Conclusion</strong>: These results could be used in the future studies for investigation of drug resistance to Bicalutamide and to develop more efficient medicines.</div> آندروژن رسپتور, بیکالوتامید, برهمکنش‌های بین مولکولی, طراحی دارو Androgen receptor, Bicalutamide, Molecular interactions, Drug design 310 318 http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-221-1&slc_lang=fa&sid=1 Noushin Hadian نوشین هادیان noushin.hd@gmail.com 10031947532846003576 10031947532846003576 No University of Shahrekord کارشناسی ارشد ژنتیک، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران. Hossein Sazegar حسین سازگار hoseinsazgar@yahoo.com 10031947532846003577 10031947532846003577 Yes . Ph.D in Physiology, Assistant Professor, Biology Dept., Faculty of Sciences, Islamic Azad University of Shahrekord, Shahrekord, Iran. دکترای فیزیولوژی، استادیار گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران Farzaneh Mohamadi Farsani فرزانه محمدی فارسانی f.mohamadi@sci.ui.ac.ir 10031947532846003578 10031947532846003578 No University of Shahrekord دکتری ژنتیک مولکولی، گروه ژنتیک، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران. Nousha Zia نوشا ضیا noosha59@yahoo.com 10031947532846003579 10031947532846003579 No University of Shahrekord دکترای بیوشیمی،استادیار گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران.