fa تأثیر هفت ترکیب مختلف موجود در عصاره شاهدانه بر میزان تجمع پپتید آمیلوئید موجود در بیماری آلزایمر از طریق شبیه‌سازی مولکولی بیوانفورماتیک Bioinformatics پژوهشي اصیل Original Article <div style="text-align: justify;"> <div dir="rtl" style="text-align: justify;"><strong>مقدمه:</strong> بیماری آلزایمر یک بیماری پیشرونده مغزی با آسیب جبران‌ناپذیر است که به تدریج توانایی‌های ذهنی بیمار تحلیل می‌رود. در این تحقیق 7 ترکیب مختلف موجود در عصاره شاهدانه در مواجهه با پپتید آمیلوئید قرار گرفته و سپس تغییر ساختار و پارامترهای ترمودینامیکی مورد ارزیابی قرار گرفت.<br> &nbsp;<strong>روش:</strong> این مطالعه از نوع شبیه‌سازی مولکولی با کمک رایانه بود. نخست ساختار سه بعدی پپتید آمیلوئید بتا در بیماران دارای بیماری آلزایمر از بانک اطلاعاتی <span dir="LTR">RCSB</span> تهیه گردید. همچنین ترکیبات اصلی عصاره شاهدانه از دیتابیس <span dir="LTR">CHEBI</span> استخراج شد. سپس هر کدام از مولکول‌های عصاره شاهدانه به طور جداگانه در محیط نرم‌افزار شبیه‌ساز دینامیک مولکولی در معرض پپتید آمیلوئید قرار گرفته و مشخصات ساختاری و ترمودینامیکی آن در مدت 3000 پیکوثانیه مورد ارزیابی قرار گرفت. برای تجزیه و تحلیل داده‌ها مقادیر مطلق هر پارامتر فیزیکی قبل و بعد از مواجهه یادداشت و سپس اختلاف قبل و بعد محاسبه گردید و در انتها درصد تغییرات با هم مقایسه شد.<br> <strong>نتایج</strong><strong>:</strong> مقایسه‌ هفت ترکیب مختلف عصاره‌ شاهدانه نشان داد که همه‌ ترکیبات عصاره‌ شاهدانه توانایی تغییر در ساختار پپتید آمیلوئید را داشتند. هر هفت ترکیب توانستند حجم، سطح مؤثر و انحلالیت در چربی پپتید آمیلوئید را تغییر دهند.<br> <strong>نتیجه‌گیری:</strong> توانایی تغییر حجم و سطح توسط این ترکیبات می‌تواند مانع تجمع پپتید آمیلوئید شود. یافته‌ها‌ی این تحقیق می‌بایست در محیط آزمایشگاهی و سپس در بدن انسان مورد بررسی قرار گیرد تا به طور قطع بتوان در مورد کارایی ترکیبات شاهدانه قضاوت کرد.<br> <br> &nbsp;<br> &nbsp;</div> <br> &nbsp;</div> <div style="text-align: justify;"><strong>Introduction:</strong> Alzheimer&#39;s disease is a progressive cerebrovascular disease with irreversible damage, which gradually degrades the mental abilities of the patient. In this study, amyloid peptide was exposed to seven different compounds in the canaboid extract and then, the structure and thermodynamic parameters were evaluated.<br> <strong>Methods:</strong> In this study, the three-dimensional structure of beta-amyloid peptide in patients with Alzheimer&#39;s disease was prepared from the rcsb database. The main components of canaboid extract were obtained from CHEBI database too. Then, amyloid peptide was subjected to each of the canaboid extract molecules in the molecular dynamics simulation software, and its structural and thermodynamic characteristics were evaluated over 3000 picoseconds.<br> <strong>Results:</strong> Comparison of seven different compounds of cannabis extract showed that all cannabis extract compounds were able to change the structure of amyloid peptide. Each compound was able to change the effective surface and volume, and the level of lipophilicty of amyloid peptides.<br> <strong>Conclusion</strong>: The ability of these compounds to change the volume and surface is effective in preventing amyloid peptide accumulation. The findings of this study should be investigated in a laboratory scale and then on the human body to detect the efficacy of canaboid extract components exactly.<br> &nbsp;</div> پپتید آمیلوئید, بیماری آلزایمر, عصارۀ شاهدانه, شبیه‌سازی, دینامیک مولکولی Amyloid peptide, Alzheimer's disease, Cannabis extract, Simulation, Molecular dynamics 222 231 http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-158-3&slc_lang=fa&sid=1 Faezeh Jalalian فائزه جلالیان jalalianr@yahoo.com 10031947532846003663 10031947532846003663 No Ph.D of Medical Nanotechnology, Assistant Professor, Laboratory Science Dept., School of Paramedicine, Shahid Sadoughi University of Medical Science, Yazd, Iran دکتری نانوفناوری پزشکی، استادیار، گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، یزد، ایران Ali Jebali علی جبالی alijebal2011@gmail.com 10031947532846003664 10031947532846003664 Yes Ph.D of Medical Nanotechnology, Assistant Professor, Laboratory Science Dept., School of Paramedicine, Shahid Sadoughi University of Medical Science, Yazd, Iran دکتری نانوفناوری پزشکی، استادیار، گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، یزد، ایران