fa بررسی بیوانفورماتیکی تأثیر فاکتور نورون‌زایی مشتق ‌شده از مغز بر میزان بیان ژن در رده سلولی SH-SY5Y بیوانفورماتیک Bioinformatics پژوهشي اصیل Original Article <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:12px;"><strong><span style="color:black;">مقدمه:</span></strong> با توجه به اهمیت بررسی و شناسایی مسیرهای حفاظتی <span dir="LTR">BDNF</span>، تحقیق اخیر با استفاده از پایگاه‌های داده بیوانفورماتیکی با هدف آنالیز میزان بیان ژن‌های ثبت شده در پایگاه داده <span dir="LTR">NCBI</span> به منظور شناخت ژن‌های بیان شده در رده سلولی <span dir="LTR">SH-SY5Y</span> در نتیجه تیمار با <span dir="LTR">BDNF</span> و استرس اکسیداتیو و شناسایی مسیر‌های حفاظتی <span dir="LTR">BDNF</span> انجام شد.<br> <strong><span style="color:black;">روش:</span></strong> در مطالعه حاضر با استفاده از سرورهای بیوانفورماتیکی و پایگاه داده <span dir="LTR">NCBI</span> و با جستجوی کتابخانه‌هایی حاوی بیش از ۴۸۰۰۰ واحد داده حاصل از تجزیه &nbsp;و تحلیل نرم افزار <span dir="LTR">Illumina</span> و <span dir="LTR">Bid studio</span> با نمونه‌برداری دستی در مرحله نخست (بر اساس <span dir="LTR">P -value</span>) و در مرحله دوم بر اساس میزان ارتباط با سازگاری نورون توسط نرم‌افزار <span dir="LTR">SPSS</span> &nbsp;نسخه 20 میزان همبستگی پیرسون و همبستگی اسپیرمن و رابطه خطی با سنجش میزان برازش یا رگرسیون اندازه‌گیری و آنالیزها انجام شد.<br> <strong><span style="color:black;">نتایج</span></strong><strong>:</strong> همبستگی پیرسون بین داده‌های <span dir="LTR">CTR</span> و <span dir="LTR">CMP</span> مثبت و رابطه خطی بین آن‌ها با اندازه‌گیری رگرسیون مثبت تأیید گردید. بر اساس نتایج به دست آمده، درصد پروتئین‌های سازگار کننده نورون از داده‌های <span dir="LTR">CTR</span> نسبت به داده‌های <span dir="LTR">CMP</span> بیشتر بود. بیشترین پروتئین‌های حفاظت نورون مربوط به حفظ شکل سلول و اسکلت سلولی و مرتبط با بقای نورون بودند.<br> <strong>نتیجه‌گیری:</strong> در نتیجه تماس نورون‌ها با <span dir="LTR">BDNF</span>، برخی از ژن‌ها به صورت اختصاصی بیان شدند؛ بنابراین این عامل می‌تواند سبب افزایش طول عمر و سازگاری بیشتر نورون‌ها باشد. </span><span style="font-family:b mitra;"></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:12px;"><strong>Introduction:</strong> Considering the importance of the evaluation and identification of BDNF protective pathways, this study was conducted to analyze the expression rate of genes registered in the NCBI database to identify the genes expressed in SH-SY5Y cell line due to BDNF protection and oxidative stress and also to identify the protective pathways of BDNF.<br> <strong>Method:</strong> In this study, bioinformatics and NCBI databases and libraries including 48000 datasets were explored and data were collected using Illumina and Bid studio software. In the first phase, sampling was performed manually based on the P-value, and in the second phase, based on the relationship with compatibility of neurons, the Pearson correlation coefficient, Spearman&#39;s correlation coefficient, and linear relationship&nbsp; were calculated by measuring fit or regression using SPSS version 20.<br> <strong>Results:</strong> The Pearson correlation between CMP and CTR data was positive; and the linear regression between them was also positive. The frequency percentage of neuron adapter proteins obtained from CTR data was higher than that from CMP data; and a great number of protective proteins were related to the protection of cell shape and cellular skeleton, and neuron survival.<br> <strong>Conclusion</strong>: Due to the contact of neurons with BDNF, some genes are specifically expressed, therefore, BDNF can increase the life and compatibility of neurons.</span></div> نورون, فاکتور نورون‌زایی مشتق‌شده از مغز, SH-SY5Y, NCBI Neuron, Brain-derived neurogenic factor, SH-SY5Y, NCBI 59 67 http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-468-1&slc_lang=fa&sid=1 Korosh Bamdad کورش بامداد kbamdad@yahoo.com 10031947532846004798 10031947532846004798 No Ph.D. in Biophysics, Assistant Professor, Biology Dept., Faculty of Sciences, Payame Noor University, Tehran, Iran دکتری بیوفیزیک، استادیار،گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران Fereshteh Dadfar فرشته دادفر fereshtehdadfar2003@yahoo.com 10031947532846004799 10031947532846004799 Yes Ph.D., in Animal physiology, Assistant Professor, Biology Dept., Faculty of Sciences, Payame Noor University, Tehran, Iran دکتری فیزیولوزی جانوری، استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران Shahnaz Eshraghi شهناز اشراقی eshrahi_a@yahoo.com 10031947532846004800 10031947532846004800 No MSc, in Biophysics, of Biology Dept., Faculty of Sciences, Payame Noor University, Tehran, Iran کارشناس ارشد بیوفیزیک ، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران