مقدمه: P۵۳ یک پروتئین سرکوبگر تومور است و جهش‌های missense زیادی در ژن این پروتئین شناسایی شده است. این جهش‌ها در تعداد زیادی از سرطان‌ها مشاهده می‌شوند. R۲۱۳G یکی از این موارد است که در ایجاد سرطان‌های متاستاتیک ریوی نقش دارد. در این پژوهش R۲۱۳G در مقایسه با گونه وحشی با استفاده از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت.
روش: برای ساختار سه بعدی پروتئین P۵۳ گونه وحشی، زنجیره A از ساختار کریستالوگرافی با pdb ایدی ۱TSR استفاده شد. برای جهش R۲۱۳G، باقیمانده ۲۱۳ این ساختار به گلایسین تغییر داده شد. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با استفاده از بسته نرم‌افزاری گرومکس ۵-۱-۲، میدان نیروی AMBER۹۹SB و مدل آب TIP۳P به مدت ۱۵ نانوثانیه و به صورت دو بار تکرار انجام شد. آنالیزهای RMSD، RMSF، شعاع ژیراسیون و انرژی پتانسیل بر روی تراژکتوری‌های حاصل انجام شد.
نتایج: آنالیز RMSF نشان داد جهش R۲۱۳G باعث تغییر انعطاف‌پذیری در یازده باقیمانده از جمله R-۲۴۸ می‌شود. جالب است که این باقیمانده‌ها نزدیک محل جهش نیستند؛ اما همه آن‌ها در قطعه ۲۲۰-۲۵۰ از این دومین واقع شده‌اند و یا باقیمانده‌های همسایه این قطعه هستند. نتایج شعاع ژیراسیون و انرژی پتانسیل کاهش پایداری پروتئین در اثر این جهش را تأیید می‌کند.
نتیجه‌گیری: آنالیز RMSF جهش R۲۱۳G به همراه تغییرات پایداری و شعاع بیان می‌کند که این جهش می‌تواند بر روی برهمکنش P۵۳ با دیگر درشت مولکول ها تأثیر گسترده‌ای بگذارد.
