Journal of Health and Biomedical Informatics
مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی
jhbmi
Medical Sciences
http://jhbmi.ir
1
admin
2423-3870
2423-3498
fa
jalali
1393
9
1
gregorian
2014
12
1
1
1
online
1
fulltext
fa
مدلسازی درخت تصمیم گیری بر اساس روشهای داده کاوی و پیشنهاد یک مدل جدید در تشخیص سرطان پوست با دو روش رنگ آمیزی ایمونوهیستوشیمی
Modeling a Data Mining Decision Tree and Propose a New Model for the Diagnosis of Skin Cancer by Immunohistochemical Staining Methods
تخصصي
Special
پژوهشي اصیل
Original Article
<p><b>مقدمه:</b> شیوههای نوین تشخیصی، نظیر رنگ آمیزی ایمونوهیستوشیمیایی در سرطان پوست به متخصصان کمک می کند تا با اطمینان بیشتر و در زمان کوتاه تر به تشخیص برسند. هدف از این مطالعه، مقایسه یک روش مبتنی بر درخت تصمیم، برای تشخیص افتراقی دو نوع سرطان پوست (سرطان سلول های بازال و سرطان سلول های سنگفرشی) بر اساس نتایج سه روش رنگ آمیزی می باشد.<br>
<b>روش:</b> در حوزه داده کاوی و با استفاده از نرم افزارهای SPSS.V19 و Clementine.V12 با روش های مدل سازی درخت تصمیم گیری CART و CHAID، داده های مربوط به 60 بیمار مبتلا به سرطان پوست مربوط به کشور مالزی بررسی شد. سه روش رنگ-آمیزی BCL2 و (Galectin-3(C و (Galectin-3(N برای تشخیص، وارد مدل شدند. بهترین متغیر پیش گویی کننده برای ساخت درخت، شناسایی و با مدل پژوهشگر-ساخته دیگری بر مبنای مقادیر بحرانی حاصل از ROC Curve Analysis و نتایج پاتولوژی مقایسه شد.<br>
<b>نتایج:</b> در مدل ترکیبی حاصل، میزان حساسیت و ویژگی تشخیص برای BCC به ترتیب 1/82 و 100 درصد، برای SCC به ترتیب 100 و 8/82 درصد، دقت کلی مدل 38/90 درصد، ارزش اخباری مثبت (PPV)برای تشخیص SCC و BCC به ترتیب 1/82 و 100 درصد و نسبت درستنمایی مثبت (PLR) برای BCC و SCC به ترتیب 8/5 و 5/5 به دست آمد.<br>
<b>نتیجهگیری: </b>مدل درخت تصمیم گیری بر اساس دو روش رنگ آمیزی ایمونوهیستوشیمی در سرطان پوست، می تواند در تشخیص این دو بیماری بدخیم کمک کند و زمینه تحقیقات بیشتر را فراهم آورد.</p>
<p><b>Introduction:</b> New diagnostic methods like immunohistochemistry staining in skin cancer can help the physicians to have more accurate diagnosis. The purpose of this study was to compare a method based on decision tree for differential diagnosis of two kind of skin cancer (Basal cell cancer and Squamous cell cancer) based on the results of staining methods.<br>
<b> Method: </b>Sixty skin cancer patients’ data from Malaysia were assessed by two methods of decision tree, CART and CHAID, in data mining and using Clementine 12 and SPSS 19. The results of three staining methods including B-cell lymphoma-2 antibody (BCL2), Galectin-3 (Cytoplasm), and Galectin-3 (Nucleus) were analyzed. The best predictive model for decision tree induction was compared with another researcher-made model based on critical values resulted from Receiver Operating Characteristic (ROC) curve analysis.<br>
<b>Results: </b>In final synthetic model, the sensitivity and specificity for Basal Cell Carcinoma (BCC) were 82.1% and 100%, and for Squamous Cell Carcinoma (SCC) were 100% and 82.8%, respectively. The overall accuracy of the model was 90.38% and the positive predictive values (PPV) for SCC and BCC were 82.1% and 100%, and the positive likelihood ratios (PLR) were 5.8 and 5.5 respectively.<br>
<b> Conclusion: </b>The decision tree model based on two methods of immunohistochemistry staining in skin cancer, can help in the diagnosis of these malignant disease and provide further studies.</p>
دادهکاوی, درخت تصمیمگیری, ایمونوهیستوشیمی, BCL-2, Galectin-3, سرطان پوست
Data mining, Decision tree, Immunohistochemistry, BCL2, Galectin-3, Skin cancer
54
62
http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-24-5&slc_lang=fa&sid=1
Afshin
Sarafi Nejad
افشین
صرّافی نژاد
a.sarafi@gmail.com
10031947532846002302
10031947532846002302
Yes
Department of medical Informatics, School of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Khorasan Razavi, Mashhad, Iran
گروه انفورماتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، خراسان رضوی، ایران
Amirhossein
Saeid
امیرحسین
سعید
10031947532846002303
10031947532846002303
No
متخصص پاتولوژی بالینی و جراحی، دانشگاه علوم پزشکی کرمان، کرمان، ایران
Isa
Mohammed Rose
عیسی
محمد رز
10031947532846002304
10031947532846002304
No
ستاد رشته پاتولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه کبانگسان، کوآلالامپور، مالزی
Alireza
Rowhanimanesh
علیرضا
روحانی منش
10031947532846002305
10031947532846002305
No
کترای کنتر ل، استادیار گروه مهندسی برق، دانشگاه نیشابور، خراسان رضوی، ایران