مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی

زمینه و هدف: اکثر قریب به اتفاق داروها با اتصال به پروتئین هدف خود عمل می‏کنند. پیش­ بینی برهمکنش­ بین مولکول‏های کوچک و پروتئین­ها، یک عنصر کلیدی در فرایند کشف دارو محسوب می‏شود. پیشرفت در ژنتیک ساختاری، دسترسی به ساختارهای سه بعدی پروتئین‏هایی که مورد هدف دارو قرار می‏گیرند را برای ما امکان‏پذیر کرده است. با توجه به اینکه پروسه‎های آزمایشگاهی در ارتباط با بررسی برهمکنش‏های بین دارو و پروتئین هدف آن با صرف هزینه‎ و انرژی بالا صورت می‏گیرد، بهره‏گیری از  روش­هایin silico می‏تواند راهکار مؤثری برای ارائه‏ی اطلاعات مفید در حمایت از روش‏های تجربی باشد.

روش بررسی: در این پژوهش نحوه­ی برهمکنش آندروژن رسپتور با داروی بیکالوتامید، به عنوان یک داروی پرکاربرد در درمان سرطان پروستات، با استفاده از آنالیزهای محاسباتی مورد بررسی قرار گرفته است.

یافته­ ها: اطلاعات حاصل از این پژوهش نشان داد، اسیدهای آمینه­ی Met-895، Trp-741، Arg-752،
Ile-899 ، Leu-707،Gly-708 ،Gln-711 ،Met-745 ، Met-749، Thr-877، Phe-764 و  Met-742که در پیوند هیدروفوب و اسیدهای آمینه­ی Asn-705 و Leu-704 که در پیوند هیدروژنی با دارو  قرار دارند، نقش بسزایی در برهمکنش میان این پروتئین و دارو ایفا می­نمایند.

نتیجه­ گیری: نتایج حاصل را می­توان در مراحل بعد، جهت بررسی مقاومت­های دارویی به بیکالوتامید و نیز جهت طراحی داروهایی کارآمدتر مورد استفاده قرار داد.