[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 7، شماره 2 - ( 6-1399 ) ::
جلد 7 شماره 2 صفحات 201-213 برگشت به فهرست نسخه ها
بهبود استنتاج شبکه‌های تنظیم بیان ژن با رویکرد تجمیع داده‌ها
عاطفه ناصری، سیدمحمدحسین هاشمی نژاد ، مهران شرقی
دکتری مهندسی کامپیوتر، استادیار، گروه مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی مهندسی، دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران
چکیده:   (128 مشاهده)
مقدمه: عمده‌ترین موضوع بر سر راه آینده بیوانفورماتیک طراحی ابزارهایی جهت مشخص کردن عملکردها و تمامی محصولات ژن‌های یک سلول است. این امر نیاز به ادغام رشته‌های متفاوت بیولوژیکی و همچنین ابزارهای پیچیده ریاضی و آمار دارد.  در این تحقیق نشان داده ­شد که می­توان با استفاده از تکنیک ­های داده ­کاوی مدل­ هایی برای تشخیص سبک زندگی افراد از لحاظ پرخطر یا کم ­خطر بودن برای ابتلاء به سرطان روده بزرگ توسعه داد.
روش: در این بررسی گذشته­ نگر، مجموعه­ داده­ای شامل 84 فرد بیمار و 225 فرد سالم، شامل 25 خصیصه جمع‌آوری شد. این اطلاعات شامل بیمارانی است که تشخیص آن­ها مربوط به سال­های 1385 تا سه ماهه اول 1393 می­باشد. از پرکاربردترین تکنیک ­ها در ادبیات انفورماتیک پزشکی شامل ماشین بردار پشتیبان، بیزین ساده، درخت تصمیم و نزدیک‌ترین همسایگی برای توسعه مدل­ ها استفاده شد.
نتایج: مدل­ های توسعه داده شده با کارایی قابل قبولی، قادر به تشخیص سبک زندگی افراد هستند. سنجه غیرتکنیکی توسعه داده شده به خوبی می­تواند ارزش واقعی تک‌تک پیش­بینی­ ها، چه درست و چه نادرست را با هزینه­ های واقعی مشخص کند و یک میزان واقعی از هزینه­ های صرفه­ جویی شده در نظام سلامت توسط هر مدل را نشان دهد. از میان مدل­ های توسعه داده شده تنها دو مدل توانست معیارهای تعیین شده جهت استفاده در دنیای واقعی را ارضا کند.
نتیجه­ گیری: مدل ­های توسعه داده شده نه تنها باید از لحاظ تکنیکی ارزیابی شوند، بلکه باید از لحاظ سنجه­ های مورد پذیرش برای حوزه پزشکی و همچنین قابلیت اجرا برای حل واقعی مسئله نیز بررسی گردند.
واژه‌های کلیدی: شبکه تنظیم بیان ژن، استنتاج شبکه تنظیم بیان ژن، الگوریتم انتشار، ادغام داده‌ها
متن کامل [PDF 1133 kb]   (31 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: بیوانفورماتیک
دریافت: 1398/7/1 | پذیرش: 1399/3/11
فایل صوتی [MP3 3883 KB]  (5 دریافت)
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Naseri A, Hasheminejad S M H, Sharghi M. Improving the Inference of Gene Expression Regulatory Networks with Data Aggregation Approach. Journal of Health and Biomedical Informatics. 2020; 7 (2) :201-213
URL: http://jhbmi.ir/article-1-440-fa.html

ناصری عاطفه، هاشمی نژاد سیدمحمدحسین، شرقی مهران. بهبود استنتاج شبکه‌های تنظیم بیان ژن با رویکرد تجمیع داده‌ها. مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1399; 7 (2) :201-213

URL: http://jhbmi.ir/article-1-440-fa.html



دوره 7، شماره 2 - ( 6-1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی Journal of Health and Biomedical Informatics
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4227