دوره 11، شماره 3 - ( 9-1403 )
جلد 11 شماره 3 صفحات 228-214 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Fallah Pour R, Jamaldini S H, Allahyari Fard N. Investigating the Interaction of Herbal Medicinal Compounds Against Mpro Protease in SARS-CoV-2 Virus Strains. jhbmi 2024; 11 (3) :214-228
URL: http://jhbmi.ir/article-1-876-fa.html
URL: http://jhbmi.ir/article-1-876-fa.html
فلاح پور رویا، جمال الدینی سید حمید، الهیاری فرد نجف. بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی علیه پروتئاز Mpro در گونه‌های ویروس SARS-CoV-2. مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1403; 11 (3) :214-228
استادیار، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران
چکیده: (56 مشاهده)
مقدمه: بیماری کرونا (COVID-19) یک بیماری عفونی است که توسط ویروس SARS-CoV-2 ایجاد میشود. شناسایی ترکیبات گیاهی مفید و به‌کارگیری آنها جهت هدف گیری پروتئین های مهم دخیل در آلوده‌سازی و تکثیر ویروس کرونا، گزینه ای کارآمد در مبارزه علیه این بیماری محسوب میشود. هدف از این پژوهش بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی بومی علیه پروتئازMpro گونه های مختلف ویروس SARS -COV2 و تعیین و ارزیابی ترکیب نهایی با روش HPLC بود.
روش کار: ساختار سه‌بعدی پروتئاز Mpro از بانک داده PDB به دست آمد. ترکیبات مختلف ضدویروسی گیاهی از پایگاه های داده و مقالات مختلف گردآوری شد. داکینگ مولکولی با استفاده از AutoDock Vina انجام شد. با استفاده از سرورهای مختلف ویژگی ها و خصوصیات ترکیبات منتخب بررسی شد. جهش زایی برای آمینواسید متیونین 49 انجام و ساختار جدید سه‌بعدی پروتئین Mpro در گونه‌های مختلف ویروس مدلسازی شد. آنالیز داکینگ برای چهار ترکیب منتخب به لحاظ انرژی اتصال انجام شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) برای بررسی پایداری ساختار نهایی و HPLC برای ارزیابی حضور ترکیب موثره در گیاه موردنظر انجام شد.
یافته‌ها: نتایج داکینگ نشان داد ترکیب Cyanidin-3 5-di-o-glucoside به لحاظ مجموع انرژی اتصال برای مهار Mpro مطلوب است. خصوصیات فارماکوکینتیک این ترکیب تعیین شد. نتایج MD نشان داد کمپلکس Mpro-Cyanidin-3 5-di-o-glucoside دارای ثبات است. با روش HPLC تأیید شد که Cyanidin-3 5-di-o-glucoside در عصاره انار ایرانی موجود است.
نتیجه‌گیری: ترکیب Cyanidin-3 5-di-o-glucoside که در عصاره انار بومی ایران یافت میشود می‌تواند با میل اتصال بالایی به Mpro متصل شده و آن را مهار کند و به عنوان دارویی که مستقیم بر ویروس کرونا تأثیر بگذارد مورد ارزیابی قرار گیرد.
روش کار: ساختار سه‌بعدی پروتئاز Mpro از بانک داده PDB به دست آمد. ترکیبات مختلف ضدویروسی گیاهی از پایگاه های داده و مقالات مختلف گردآوری شد. داکینگ مولکولی با استفاده از AutoDock Vina انجام شد. با استفاده از سرورهای مختلف ویژگی ها و خصوصیات ترکیبات منتخب بررسی شد. جهش زایی برای آمینواسید متیونین 49 انجام و ساختار جدید سه‌بعدی پروتئین Mpro در گونه‌های مختلف ویروس مدلسازی شد. آنالیز داکینگ برای چهار ترکیب منتخب به لحاظ انرژی اتصال انجام شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) برای بررسی پایداری ساختار نهایی و HPLC برای ارزیابی حضور ترکیب موثره در گیاه موردنظر انجام شد.
یافته‌ها: نتایج داکینگ نشان داد ترکیب Cyanidin-3 5-di-o-glucoside به لحاظ مجموع انرژی اتصال برای مهار Mpro مطلوب است. خصوصیات فارماکوکینتیک این ترکیب تعیین شد. نتایج MD نشان داد کمپلکس Mpro-Cyanidin-3 5-di-o-glucoside دارای ثبات است. با روش HPLC تأیید شد که Cyanidin-3 5-di-o-glucoside در عصاره انار ایرانی موجود است.
نتیجه‌گیری: ترکیب Cyanidin-3 5-di-o-glucoside که در عصاره انار بومی ایران یافت میشود می‌تواند با میل اتصال بالایی به Mpro متصل شده و آن را مهار کند و به عنوان دارویی که مستقیم بر ویروس کرونا تأثیر بگذارد مورد ارزیابی قرار گیرد.
فایل صوتی [M4A 816 KB] (2 دریافت)
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
