دوره 10، شماره 4 - ( 12-1402 )                   جلد 10 شماره 4 صفحات 366-357 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ghasemi M, Zamani J, Minuchehr Z, Shamsara M. In Silico Modeling of a Mutant Cas9 Protein for High-Fidelity Genome Editing. jhbmi 2024; 10 (4) :357-366
URL: http://jhbmi.ir/article-1-838-fa.html
قاسمی مهسا، زمانی جواد، مینوچهر زرین، شمس آرا مهدی. مدل‌سازی in silico یک پروتئین Cas9 جهش یافته با هدف افزایش دقت ویرایش ژنوم. مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1402; 10 (4) :357-366

URL: http://jhbmi.ir/article-1-838-fa.html


دکتری تخصصی ژنتیک مولکولی، دانشیار، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی، گروه زیست فناوری دامی، تهران، ایران
چکیده:   (548 مشاهده)
مقدمه: سیستم CRISPR/Cas، سیستم ایمنی اکتسابی باکتری­ها در مقابله با عوامل مهاجم خارجی است. پروتئین Cas9 باکتری استرپتوکوکوس پیوژنز، رایج­ترین پروتئین Cas استفاده شده در ویرایش ژنوم می­باشد؛ اما پروتئین­های Cas9 دارای مشکلاتی مانند وقوع جهش­های نابه‌جا هستند که مانعی مهم در مسیر به کارگیری آن­ها برای مقاصد درمانی می­باشد. هدف از این مطالعه، طراحی یوانفورماتیکی یک پروتئین Cas9 جهش یافته به منظور افزایش دقت آنزیم در امر ویرایش ژنوم است. 
روش: در این مطالعه ابتدا با انتخاب برخی از جهش­ها و اعمال آن در پروتئین، Cas9 جدید به صورت in silico طراحی شد. با روش داکینگ مولکولی نحوه اتصال spCas9 جهش یافته و وحشی به DNA مورد بررسی قرار گرفت. در آخر، پایداری دو پروتئین جهش یافته و وحشی با استفاده از دینامیک مولکولی مورد ارزیابی قرار گرفت.
نتایج: نتایج این مطالعه منجر به طراحی یک پروتئین جهش یافته با 5 جهش شد. نتایج داکینگ مولکولی امتیاز 1073/86- را برای پروتئین تیپ وحشی و امتیاز 349/41- را برای پروتئین جهش یافته نشان داد.
نتیجه‌گیری: بررسی داکینگ مولکولی نشان داد که از پیوندهای بین پروتئین و DNA در حالت جهش یافته کاسته شده است. همچنین، نتایج دینامیک مولکولی نشان داد که پایداری دو پروتئین جهش یافته و تیپ وحشی مشابه یکدیگر میباشند.

 
متن کامل [PDF 1279 kb]   (105 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: بیوانفورماتیک
دریافت: 1402/10/12 | پذیرش: 1402/11/30

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Journal of Health and Biomedical Informatics

Designed & Developed by : Yektaweb